Wenn die Einzelstrukturen von verschiedenen Autoren stammen, müssen eventuell auch die Orientierungen der Moleküle vereinheitlicht und daher geänderte Datensätze gespeichert werden.
Bei großen vielkettigen Strukturen ( wie sie z.B. vom EBI Protein Quaternary Structure Server zu bekommen sind ) zeigt sich eine Einschränkung des PDB File-Formates :
das Alphabet hat nicht genug Buchstaben, die Chime unterscheiden kann.
www.biologie.uni-hamburg.deThen they have to be aligned ( e.g. with the swiss prot viewer ) and the coordinates saved in the new orientation.
With very large multichain structures ( as e.g. obtained from the EBI Protein Quaternary Structure server ) there is a limitation in the PDB file format :
there are not enough letters of the alphabet that Chime can discern.
www.biologie.uni-hamburg.deWenn die Einzelstrukturen von verschiedenen Autoren stammen, müssen eventuell auch die Orientierungen der Moleküle vereinheitlicht und daher geänderte Datensätze gespeichert werden.
Bei großen vielkettigen Strukturen ( wie sie z.B. vom EBI Protein Quaternary Structure Server zu bekommen sind ) zeigt sich eine Einschränkung des PDB File-Formates : das Alphabet hat nicht genug Buchstaben , die Chime unterscheiden kann .
Die anzuzeigenden Ketten müssen mit einzelnen Großbuchstaben gekennzeichnet sein, kleinbuchstaben und Nummern versteht Chime nicht.
www.biologie.uni-hamburg.deThen they have to be aligned ( e.g. with the swiss prot viewer ) and the coordinates saved in the new orientation.
With very large multichain structures ( as e.g. obtained from the EBI Protein Quaternary Structure server ) there is a limitation in the PDB file format : there are not enough letters of the alphabet that Chime can discern .
So chains to display have to be termed with single capital letters instead of lowercase or numbers.
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With very large multichain structures ( as e.g. obtained from the EBI Protein Quaternary Structure server ) there is a limitation in the PDB file format :
there are not enough letters of the alphabet that Chime can discern.
www.biologie.uni-hamburg.deWenn die Einzelstrukturen von verschiedenen Autoren stammen, müssen eventuell auch die Orientierungen der Moleküle vereinheitlicht und daher geänderte Datensätze gespeichert werden.
Bei großen vielkettigen Strukturen ( wie sie z.B. vom EBI Protein Quaternary Structure Server zu bekommen sind ) zeigt sich eine Einschränkung des PDB File-Formates :
das Alphabet hat nicht genug Buchstaben, die Chime unterscheiden kann.
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With very large multichain structures ( as e.g. obtained from the EBI Protein Quaternary Structure server ) there is a limitation in the PDB file format : there are not enough letters of the alphabet that Chime can discern .
So chains to display have to be termed with single capital letters instead of lowercase or numbers.
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Bei großen vielkettigen Strukturen ( wie sie z.B. vom EBI Protein Quaternary Structure Server zu bekommen sind ) zeigt sich eine Einschränkung des PDB File-Formates : das Alphabet hat nicht genug Buchstaben , die Chime unterscheiden kann .
Die anzuzeigenden Ketten müssen mit einzelnen Großbuchstaben gekennzeichnet sein, kleinbuchstaben und Nummern versteht Chime nicht.
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