Les opposants à ce projet soutiennent que la suppression totale de cette espèce risque de déséquilibrer l'écosystème, dans lequel la mouche tsé-tsé a sans doute sa place.
Par l'extension extrême de la surface en friche, les régions sèches redeviennent de la brousse, et donc à long terme un espace de vie pour la mouche tsé-tsé.
Vers les années 1920 ils font figure d'excellents éleveurs de bétail, mais leurs troupeaux sont décimés par la mouche tsé-tsé quelques années plus tard.
Il est également utilisé, dans une moindre mesure, pour l'élimination des acariens du bétail ou pour lutter contre la mouche tsé-tsé en zone tropicale.
