Ab ca. 450 °C ist das nicht mehr möglich, da der Sauerstoff dann sofort im Sinne einer Teilverbrennung mit dem brennbaren Reaktorinhalt (Gas, Kohlenstoff) reagiert.
Nach der Pyrolyse wird das entstandene Gasgemisch schnell unter 200 °C abgekühlt (gequencht), um die weitere Zersetzung zum elementaren Kohlenstoff und Wasserstoff zu vermeiden.
Aus diesem Grund müssen Patienten mindestens drei Stunden vor Messung nüchtern sein, um mögliche Interferenzen mit Kohlenstoff aus der Nahrung auszuschließen.